Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms