Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms