Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDE1Q9NZC3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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