Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RDH8Q9NYR8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH8Q9NYR8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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