Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms