Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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