Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms