Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms