Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms