Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms