Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCNAQ96QF7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms