Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms