Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELP4Q96EB1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms