Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRAT1Q92837 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms