Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms