Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms