Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms