Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms