Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PRAMEF20Q5VT98 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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