Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms