Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms