Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC27Q2M243 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms