Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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RRN3P1Q2M238 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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