Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FSCN1Q16658 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms