Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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