Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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