Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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