Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLCA4Q14CN2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms