Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms