Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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