Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms