Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE7AQ13946 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms