Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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