Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CAMK2DQ13557 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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