Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms