Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDAP1Q13442 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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