Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms