Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TROQ12816 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TROQ12816 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TROQ12816 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TROQ12816 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms