Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TFCP2Q12800 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFCP2Q12800 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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