Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCRN3Q0VDG4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCRN3Q0VDG4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms