Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms