Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms