Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms