Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms