Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms