Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX1P83916 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX1P83916 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX1P83916 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms