Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms