Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTBP2P56545 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms