Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms