Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR4P51571 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR4P51571 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR4P51571 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR4P51571 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR4P51571 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR4P51571 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR4P51571 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms